- Estudios de biodiversidad de Oaxaca I. Identificación molecular de insectos y catálogo fotográfico de la entomofauna de Monte Albán. SIP 20251059.
- Barreras o puentes: Distribución de tres Ordenes (8 familias) de insectos en los Valles Centrales de Oaxaca y montañas aledañas, usando código de barras de ADN. Proyecto CONAHCYT Ciencia Básica y de Frontera 2024-26.
- Interacciones bi-tróficas en tres biomas del estado de Oaxaca; selva baja, matorral y bosque de niebla. SIP 20241916.
- Bosques tropicales de Oaxaca: cambio climático y biodiversidad. SIP20231641.
- Código de barras de ADN, diversidad florística y distribución del bosque de niebla. SIP 20221660.
- Identificación molecular de plantas, etnobotánica y dinámica de bosques asociados con las milpas. Clave SIP 20211341.
- Identificación de plantas del bosque templado de la Mixteca Baja de Oaxaca por medio del Código de barras genético I. SIP20201673.
- Diversidad, dinámica y monitoreo de especies de bosques templados húmedos SIP20195601.
- Patrones de biodiversidad de plantas en un bosque mesófilo de montaña SIP20180889.
- Estudios de relaciones antrópicas con sistemas biológicos naturales en Oaxaca SIP20171792.
- Transferencia de oligonucleótidos SSR de la manzana, a una rosácea silvestre. . Proyecto modalidad especial. SIP 20161300.
- Análisis genéticos de una especie vegetal nativa de Oaxaca, que tolera sitios perturbados. SIP 20151342.
- Patrones genéticos de una rosácea nativa del estado de Oaxaca, que habita en lugares altamente perturbados. SIP 20140825.
- Biodiversidad vegetal y sus interacciones con el humano en sistemas forestales del sur de México. SIP 20131425.
- Patrones ecológicos en sistemas forestales del sureste de México. SIP 20121168.
- Patrones de diversidad biológica en el sureste de México. SIP 20110385.
- Proyecto: Ecología y Restauración de Paisajes Forestales en Zonas Secas. SIP20100292 .
- Ecología y Restauración de Paisajes Forestales en Zonas Secas III. SIP 20090394.
- Ecología y restauración de paisajes forestales en zonas secas II. Análisis exploratorio. SIP 20080638.
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- Restoration of Forest Landscapes for Biodiversity Conservation and Rural Development in the Drylands of Latin America. 2007-2009. INCO V Program (REFORLAN FP6-2004-INCO-DEV-3 032132).
- Plan de Manejo y Conservación de tres especies comerciales de bromelias epifitas en los valles centrales de Oaxaca. SIP 20060111 y SEMARNAT-CONACYT-2004-CO1-48316.
- Biodiversity, Conservation, Restoration and Sustainable Use in Fragmented Forest Landscapes (BIOCORES). United Nations Environmental Program (UNEP). Cambridge University-United Kindom. Junio 2002-Junio 2005.
- Fundamentos Científicos para la Conservacion y Aprovechamiento de Pinus chiapensis. CGEPI. Proyecto No. 260703. Julio 2001-Junio 2004. CGEPI 20010876.
- Biodiversity, Conservation and Sustainable Use in Mexican Cloud Forest. Darwin Initiative for the Survival of Species (en colaboración con el Institute of Ecology and Resource Management, de la Universidad de Edimburgo, Escocia). En co-dirección con el Dr. Adrian Newton. 1999-2002.
- Sistemas de cruzamiento y ensayo de procedencias en Pinus chiapensis (Mart.
- Andresen) 2001. CGPI980030
- Estudio Demográfico y Genético para la Conservación y Manejo de Pinus chiapensis
- (Mart.)Andresen en el sureste de México. 1998. SIBEJ clave RNMA-22 y DEPI, 1996
